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                Nat Immunol:判定出对立特别靶标的T细胞

                作者: 工夫:2019-11-28 点击数:


                  2019年11月21日 讯 /生物谷BIOON/ --当接种疫苗,或许排除过敏原以及微生物病原体之后,免疫零碎激活,发生的T细胞亚群将辨认并肃清“外来入侵者”。这些T细胞中的一些被可以立刻发扬作用,而另一些则开展为“影象T细胞”,满身循环的同时维护宿主免受入侵者再次呈现的打击。

                  现在,麻省理工学院的研讨职员如今曾经设计出一种办法,以判定具有特定靶标的T细胞,经过高通量单细胞RNA测序,作者可以确定某一细胞在给定工夫的基因表达状况,进而提醒T细胞的共同功用。在这项新研讨中,研讨职员运用该技能判定了发生花生过敏患者中特殊的炎性T细胞。



                  研讨职员经过运用这种办法来研讨患者的T细胞对花生过敏的特性,进而可以协助开辟特定疗法并确定该疗法能否对特定患者无效。此类研讨还可以协助指点研讨职员开辟和测试新疗法。

                  相干后果克日宣布在《Nature Immunology》杂志上。该论文的次要作者是研讨生Ang Andy Tu和博士后Todd Gierahn。

                  研讨职员的新办法树立在他们先前的任务开辟的技能之上,该技能可以在少量细胞上疾速实行单细胞RNA测序。经过对信使RNA停止测序,迷信家可以发明在给定工夫表达的基因,从而使他们理解单个细胞的功用。

                  在T细胞等免疫细胞上停止RNA测序十分令人感兴味,由于T细胞在免疫反响中具有很多差别的作用。但是,曩昔的测序研讨无法准确找到对特定靶标或抗原有反响的T细胞群体。这是由T细胞受体(TCR)的序列特性决议的。单细胞RNA测序通常仅标志和测序每个RNA分子的此中一端,而T细胞受体基因的大局部变异都位于序列的另一端,因此惯例测序手腕无法辨认这些差别。“很长一段工夫以来,人们不断在用这种传统的办法剖析T细胞及其转录组特性,但无法确定T细胞的受体信息。”

                 在单个T细胞中,编码T细胞受体的RNA缺乏细胞总RNA的1%,因而MIT小组提出了一种扩增这些特定RNA分子,然后将其从总样品中“拉出”的办法。每个RNA分子都标志有条形码,以提醒其细胞泉源信息,因而研讨职员可以将T细胞的靶标与其RNA表达方法停止婚配。这使他们可以确定哪些基因在靶向特定抗原的T细胞群体中具有活性。“要理解T细胞的功用,就必需理解它们的受体辨认的靶点信息。我们开辟的这种办法可以应用现有的单细胞RNA测序文库,并提取想要表征的相干序列。”研讨职员说,该技能的另一个长处是它不需求昂贵的化学药品,它依赖于很多实行室曾经拥有的设置装备摆设,而且可以使用于很多先前处置过的样品。

                  在文章中,研讨职员证明,在给小鼠接种了针对人乳头瘤病毒的疫苗后,可以运用该技能挑选出对人乳头瘤病毒有活性的小鼠T细胞。他们发明,虽然一切这些T细胞都对病毒起反响,但这些细胞具有差别的TCR,而且处于差别的发育阶段:此中一些T细胞被激活以杀去世被熏染的细胞,而另一些则专注于生长和破裂。

                  然后,研讨职员剖析了四名对花生过敏患者的T细胞。将细胞表露于花生过敏原后,他们可以判定出对那些过敏原具有活性的T细胞。他们还表现出T细胞的哪些亚群是最活泼的,并发明了一些正在发生通常与过敏反响有关的炎性细胞因子。“我们如今可以开端对数据停止分层,以提醒最紧张的细胞是什么,而曩昔仅凭RNA测序无法辨认这些细胞。


                 

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